Os terminais dos Trevos das Margaridas e das Missões, na Zona Norte do Rio, não estão inclusos na programação inicial do BRT Transbrasil. Segundo a Secretaria Municipal de Transportes, os espaços foram projetados para uma futura expansão do sistema. Neste primeiro momento, os terminais possuem estrutura parcial para servir de apoio para o corredor.  

Ainda de acordo com a pasta, o Terminal Margaridas serviria de conexão com os ônibus intermunicipais que chegam da Rodovia Presidente Dutra. Já o Terminal Missões, receberia os coletivos da Rodovia Washington Luís.

O BRT Transbrasil está em funcionamento desde o último sábado (24). A operação acontece de 12h às 14h, entre o Terminal Gentileza, na região central da cidade, e a Penha, na Zona Norte.